La 15 ani după Al Doilea Impact, apaticul adolescent Shinji se alătură grupului NERV și tatălui său în lupta contra Îngerilor, însă adevărul i-ar putea nimici pe toți....
Plasată în secolul 23 pe Marte, animația urmărește investigația asupra unui caz de crimă realizată de cuplul format din detectivul particular Aline Ruby și tovarășul ei android Carlos Rivera....